Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC58Q96CX6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms