Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms