Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms