Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms