Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms