Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF1Q8N6C5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms