Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms