Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms