Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms