Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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