Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms