Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP77Q6ZQR2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms