Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms