Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ3

CD300LD, CMRF35-like molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LDQ6UXZ3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300LDQ6UXZ3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms