Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRN1Q6UXK5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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