Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms