Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms