Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM236Q5W0B7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms