Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HP1BP3Q5SSJ5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms