Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms