Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF1Q3BBV0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms