Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms