Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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