Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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