Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP6Q16828 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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