Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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NDUFA9Q16795 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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NDUFA9Q16795 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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