Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTF1Q16619 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTF1Q16619 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTF1Q16619 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms