Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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