Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CARTPTQ16568 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms