Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms