Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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CYTH1Q15438 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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