Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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