Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms