Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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