Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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