Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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