Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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