Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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