Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PLD1Q13393 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLD1Q13393 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms