Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms