Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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