Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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