Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms