Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms