Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms