Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms