Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms