Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms