Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAMQ00059 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms