Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.9 ms